COSMIC 和 CCLE
使用来自癌症体细胞突变目录(COSMIC)和癌细胞系百科全书(CCLE)的1,393种癌细胞系的全基因组基因分型数据。
使用来自癌症体细胞突变目录(COSMIC)和癌细胞系百科全书(CCLE)的1,393种癌细胞系的全基因组基因分型数据。
方式:使用ntfs-3g
步骤:
1、加源 wget -O /etc/yum.repos.d/epel.repo http://mirrors.aliyun.com/repo/epel-7.repo
CentOS默认源里没有ntfs3g,可通过添加aliyun的epel源来yum安装
2、安装 yum update;
yum install ntfs-3g
3、grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg
该过程中会自动找到win10的启动项目,并加入启动列表,重启即可看到centos7和win10的启动
使用grub2-editenv list 可以查看grub.cfg中的入口项,通过grub2-set-default + 字符串可以设置默认的启动项
# grub2-editenv list
saved_entry=CentOS Linux 7 (AltArch)
[root@localhost ~]# grub2-set-default "CentOS Linux 7 (AltArch)"
问题:
有些主板读取不出来。手动:
menuentry 'Windows 10 (loader) (on /dev/nvme0n1p1)' --class windows --class os $menuentry_id_option 'osprober-chain-9EB03FC6B03FA3A5' {
insmod part_msdos
insmod ntfs
set root='hd0,msdos1'
if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint='hd0,msdos1' 9EB03FC6B03FA3A5
else
search --no-floppy --fs-uuid --set=root 9EB03FC6B03FA3A5
fi
parttool ${root} hidden-
drivemap -s (hd0) ${root}
chainloader +1
}
menuentry "Windows 10" {
set root='(hd0,gpt2)'
chainloader /EFI/microsoft/BOOT/bootmgfw.efi
}
Western Blot内参抗体种类很多,比如β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B等,那么针对自己的实验,我们该如何做选择呢?下面简单介绍下选择内参抗体应遵循的原则:
> 样本的种属来源
选择内参抗体首先要考虑的是实验样本的来源。
1. 哺乳动物的组织或者细胞样本,通常选择β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na/K ATPase等。
2. 植物来源实的验样本,则可以选择plant actin、Rubisco等。
3. 其他来源样本研究较少,所以研究者就需要参照文献报导,选择合适的抗体作为内参。
> 目的蛋白的分子量大小
选择内参抗体时应该考虑目的蛋白分子量的大小,通常应该保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5 kDa以上。比如目的蛋白分子量为45 kDa,此时不适宜选择β-actin(分子量为42 kDa)作为内参,可以考虑选择GAPDH(分子量为38 kDa)或者β-tubulin(分子量为55 kDa)作为内参。
> 目的蛋白的表达部位 一般实验主要是检测胞浆内的表达蛋白,选择β-actin、β-Tubulin、GAPDH的抗体就可以了;而对于核蛋白的定量,特别是样本来源于细胞核内蛋白时,选择恰当的核蛋白内参则更能体现内部参照的价值,常用的核内参抗体有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常见的核蛋白内参还有PCNA、K70、K80等,在一些文献报道中,Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用;对于膜蛋白检测,最常用的内参抗体为Na/K ATPase;对于线粒体蛋白的检测,常用VDAC1和COX IV作为内参抗体。
以上几条原则只是针对通常情况,需要注意的问题是——内参的选择还需要考虑实际的实验环境,比如某些细胞由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达量增高,此时GAPDH就不适合做内参了;再比如在涉及细胞增殖相关试验中,c-Jun由于自身表达变化也不适合做内参;而在凋亡实验时,TBP、Lamin等也不适合作为内参。因此设计实验方案时应该综合考虑多方面因素并查询相关文献,在实验过程中也应该注意如果内参表达出现异常,可能是由于特殊原因导致,因而需要查阅相关文献并更换其他抗体作为内参。
实验原理:
MTT细胞增殖及细胞毒性检测(MTT Cell Proliferation and Cytotoxicity Assay )被广泛应用于细胞增殖和细胞毒性的检测。
MTT可以被线粒体内的一些脱氢酶还原生成结晶状的深紫色产物formazan。在特定溶剂存在的情况下,可以被完全溶解。然后通过酶标仪可以测定570nm波长附近的吸光度。细胞增殖越多越快,则吸光度越高;细胞毒性越大,则吸光度越低。
保存条件:
4℃或-20℃保存,MTT需避光保存,一年有效;MTT配制成溶液后需-20℃避光保存;Formazan溶解液也可以室温保存。
实验步骤:
1. MTT溶液的配制:用5ml MTT溶剂溶解25mg MTT,配制成5mg/ml的MTT溶液。配制后即可使用,或直接 -20℃避光保存,也可以根据需要适当分装后-20℃避光保存。
2. 通常细胞增殖实验每孔加入100微升2000个细胞,细胞毒性实验每孔加入100微升5000个细胞(具体每孔所用的细胞的数目,需根据细胞的大小,细胞增殖速度的快慢等决定)。按照实验需要,进行培养并给予0-10微升特定的药物刺激。
3. 每孔加入10微升MTT溶液,在细胞培养箱内继续孵育4小时。
4. 每孔加入100微升Formanzan溶解液,在细胞培养箱内再继续孵育。直至在普通光学显微镜下观察发现formazan全部溶解。通常37℃孵育4小时左右,紫色结晶会全部溶解。如果紫色结晶较小较少,溶解的时间会短一些。如果紫色结晶较大较多,溶解的时间会长一些。
5. 在570nm测定吸光度。如无570nm滤光片,可以使用560-600nm的滤光片。
注意事项:
由于使用96孔板进行检测,如果细胞培养时间较长,一定要注意蒸发的问题。一方面,由于96孔板周围一圈最容易蒸发,可以采取弃用周围一圈的办法,改加PBS,水或培养液;另一方面,可以把96孔板置于靠近培养箱内水源的地方,以缓解蒸发。
MTT溶剂在低温情况下会凝固,使用前请室温放置或20-25℃水浴温育片刻至全部融解后使用。
MTT配制成溶液后为黄色,需避光保存,长时间光照会导致失效。当颜色变为灰绿色时,请勿使用。MTT溶液在4℃、冰浴等较低温度情况下会凝固,可以20-25℃水浴温育片刻至全部融解后使用。
Formazan溶解液结冻或产生沉淀时可以37℃水浴孵育以促进溶解,并且必须在全部溶解并混匀后使用。
本试剂盒的检测依赖于脱氢酶催化的反应,所以还原剂(例如一些抗氧化剂)会干扰检测,如果待检测体系中存在较多的还原剂,需设法去除。
用酶标仪检测前需确保每个孔内没有气泡,否则会干扰测定。
与其他实验的对比:
麻杏石甘汤:
麻黄6g,杏仁6g,石膏一般是麻黄的2-4倍,甘草6g。
药理当代药理研究证明,麻黄中挥发油对流感病毒有抑制作用,有解热作用,有镇咳作用,伪麻黄碱有显著的利尿作用。杏仁中苦杏仁甙在体内慢慢分解,逐渐产生微量的氢氰酸,对呼吸中枢有镇静作用,使呼吸运动趋于安静而达到镇咳平喘的作用。石膏有解热作用,石膏中的钙内服经胃酸作用,一部分变成可溶性钙盐,至肠入血能增加血清中钙离子的浓度,可抑制神经应激性(包括体温调节中枢神经),减低骨骼肌的兴奋性,缓解肌肉痉挛,又能减小血管渗透性,故有解热、镇痉、消炎的作用。甘草中甘草甜素或其钙盐有较强的解毒作用,可缓解自体中毒,甘草中甘草酸有抗炎作用和抗变态反应作用,甘草有祛痰作用,能促进咽喉和支气管的分泌,使痰易于咯出,甘草次酸有显著的镇咳作用。实验也证明,本汤有平喘、镇咳、祛痰、解热、镇静、利尿等作用。
小儿治疗中,麻黄看病情减量,石膏主要作用可能是补钙,可以用钙片代替。可以再加桔梗5g、黄芩5g
常见中药的小儿用量:
桑叶3g 连翘4g、川贝母4g、杏仁4g、桔梗5g、黄芩5g、栀子3g、百部5g、鱼腥草6g、薄荷3g、甘草3g。如有发热,鼻塞流涕加金银花5 g、苍耳子3g、辛荑花4g;咽痛、咽痒、声音嘶哑甚者加牛蒡子5g、蝉蜕3g、射干4g;大便秘结加郁李仁3g、冬瓜仁6g、枳壳5g。每日1剂,开水煎,分3~4次温服。(以上为3岁患儿剂量,3岁以 上略增。)
另外还有发黄升麻汤
有以下情况应考虑为肠系膜淋巴结炎:发病前有上呼吸道感染或肠道感染;临床表现有发热、腹痛、呕吐等症状;腹痛多位于脐周,为阵发性、痉挛性痛,少有反跳痛及腹肌紧张;腹部b超提示多发肠系膜淋巴结肿大,并排除其他引起腹痛的常见病。
可能为呼吸道病毒或细菌感染引起肠系膜根部、回盲末端及回盲部肠系膜淋巴结炎。淋巴系统是身体重要的防御装置,当身体某器官或部位发生病变时,毒素、细菌等均可经淋巴管到达相应的局部淋巴结。该局部淋巴结可阻截或清除这些异物,成为阻止病变扩散的直接屏障,此时淋巴结内的细胞迅速增殖,功能旺盛,体积增大。
肠系膜淋巴结炎分为急性和慢性,有发烧为急性,发病率男性高于女性, 大多数病因为上呼吸道的病毒感染,病毒多为柯萨奇B组病毒。B组病毒有6个血清型B1-B6。
从1225例送检标本中检出病毒1097例,其中柯萨奇病毒976例,埃可病毒121例.细菌培养检出细菌118例,阳性率为9.6%;其中溶血性链球菌73例,占61.9%;金黄色葡萄 球菌31例,占26.2%;其他14例,占11.9%
该病一般7-10天自愈。
多用抗生素,一般7天治愈,
结合中医可缩短病程,治愈约5天。
其中:发烧症状西医一般3.5天,结合中医2.5天,腹痛5天缩短为3天,消除淋巴结肿大由8天缩短为6天。
一般是解毒散结的,以下仅作参考,还未找到特效药。
中药:裸花紫珠片、猫爪草的煎剂或胶囊、清热理气活血汤 、腹痛散、仙方活命饮、柴胡疏肝散、理气化痰汤、四逆理气汤、散结止痛汤、清热通腑化瘀汤、保和丸、消积止痛汤、消痰通络汤、沙棘干乳剂、四磨汤、加味建中汤、行气止痛汤、理气逐瘀汤、四磨汤、缓急止痛汤。
肠系膜淋巴结炎是由于邪气侵犯肠道,应以通为主,怀疑多为脾虚者发此病,健脾中药可能有用。
单独的抗柯萨奇病毒特效药:
早期用贯众,晚期用黄芩;通过抑制其生物合成起抗病毒作用,如贯众、板蓝根、大黄、连翘、酱瓜、大蒜等;有的既能直接杀死又能抑制生物合成,如虎杖、桑寄生、羊栖菜等。
肚脐中药贴:中脘穴、神阙穴、关元穴,
按摩刺激穴位:足三里、四缝穴
卸载之前安装错误的:
ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d stop
systemctl stop shadowsocks.service
pip uninstall shadowsocks
yum remove python-pip
安装
yum -y install python-pip
pip install --upgrade pip
pip install shadowsocks
或者
在控制台执行以下命令安装 pip:
curl "https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py" -o "get-pip.py"
python get-pip.py
在控制台执行以下命令安装 shadowsocks:
pip install --upgrade pip
pip install shadowsocks
配置:
vim /etc/shadowsocks.json
{
"server": "0.0.0.0",
"server_port": 8080,
"password": "填写密码",
"method": "aes-256-cfb"
}
ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d stop
ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d start
ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d restart
后台一直运行
nohup ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d start &
自启动方法一:
打开/etc/rc.d/rc/local文件,在末尾增加内容或者命令:
echo ‘ssserver -c /etc/shadowsocks.json -d start’ >> /etc/rc.local
entos7 echo进去带了引号,原因未知,手动编辑 /etc/rc.d/rc.local就可以了
在centos7中,/etc/rc.d/rc.local的权限被降低了,所以需要执行如下命令赋予其可执行权限
chmod +x /etc/rc.d/rc.local
以下方法都失败了
编辑shadowsocks 服务的启动脚本文件,内容如下:
[root@server ~]# vim /etc/systemd/system/shadowsocks.service
[Unit]
Description=Shadowsocks
[Service]
TimeoutStartSec=0
ExecStart=/usr/bin/ssserver -c /etc/shadowsocks.json
[Install]
WantedBy=multi-user.target
执行以下命令启动 shadowsocks 服务:
[root@server ~]# systemctl enable shadowsocks
[root@server ~]# systemctl start shadowsocks
启动一个服务:systemctl start shadowsocks
关闭一个服务:systemctl stop shadowsocks
重启一个服务:systemctl restart shadowsocks
显示一个服务的状态:systemctl status shadowsocks
在开机时启用一个服务:systemctl enable shadowsocks
在开机时禁用一个服务:systemctl disable shadowsocks
查看服务是否开机启动:systemctl is-enabled shadowsocks
查看已启动的服务列表:systemctl list-unit-files|grep enabled
说明:启用服务就是在当前“runlevel”的配置文件目录/etc/systemd/system/multi-user.target.wants/里,建立/usr/lib/systemd/system里面对应服务配置文件的软链接;禁用服务就是删除此软链接。
检查 shadowsocks 服务是否已成功启动,可以执行以下命令查看服务的状态:
systemctl status shadowsocks -l
确认服务启动成功后,配置防火墙规则,开放你配置的端口,不然客户端是无法连接的:
[root@server ~]# firewall-cmd --zone=public --add-port=8080/tcp --permanent
success
[root@server ~]# firewall-cmd --zone=public --add-port=8081/tcp --permanent
success
[root@server ~]# firewall-cmd --reload
success
状态:
systemctl enable shadowsocks.service
systemctl start shadowsocks.service
systemctl status shadowsocks.service
打开阿里云防火墙和各种防火墙
firewall-cmd --permanent --add-port=443/tcp
firewall-cmd --permanent --add-port=443/udp
firewall-cmd --reload
启动和看状态
systemctl start shadowsocks.service
systemctl stop shadowsocks.service
systemctl restart shadowsocks.service
systemctl enable shadowsocks.service
systemctl status shadowsocks -l
安装 shadowsocks-libev
参考文献:
启动不起来的话
删除了/usr/lib/systemd/system/shadowsocks-libev.service中service下GROUP那一行之后就可以正常启动了。
执行安装 Shadowsocks 的命令之前,我们需要先切换到 root 用户(直接以 root 身份登入;或是以普通用户登入,通过命令 sudo su -
切换为 root 用户),或者使用普通用户,但在每条命令前加上 sudo
。
另外,后续的配置也需要以 root 用户的身份进行。
具体安装 shadowsocks-libev 的命令如下:
cd /etc/yum.repos.d/
curl -O https://copr.fedorainfracloud.org/coprs/librehat/shadowsocks/repo/epel-7/librehat-shadowsocks-epel-7.repo
yum install -y shadowsocks-libev
安装完成后,会有 ss-local
, ss-manager
, ss-nat
, ss-redir
, ss-server
, ss-tunnel
命令可用。
其中,作为服务器,我们需要的是 ss-server
,不过后文中我们将通过服务文件启动 Shadowsocks,而不会直接与 ss-server
命令打交道。
注,如果安装报类似如下错误:
Error: Package: shadowsocks-libev-3.1.3-1.el7.centos.x86_64 (librehat-shadowsocks)
Requires: libsodium >= 1.0.4
Error: Package: shadowsocks-libev-3.1.3-1.el7.centos.x86_64 (librehat-shadowsocks)
Requires: mbedtls
说明系统没有启用 EPEL (Extra Packages for Entreprise Linux)。那么我们需要首先启用 EPEL,再安装 shadowsocks-libev:
yum install -y https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-7.noarch.rpm
yum install -y shadowsocks-libev
在继续后文的配置之前,我们先在命令行中执行一次 ss-server
命令,以确认 shadowsocks 及其依赖已正确安装。
如运行正常,则跳过常见问题,继续添加配置文件。
ss-server
报错:ss-server: error while loading shared libraries: libmbedcrypto.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
:使用 root 身份执行以下命令即可:
cd /usr/lib64
ln -s libmbedcrypto.so.1 libmbedcrypto.so.0
COPR 里的 shadowsocks-libev 默认读取位于 /etc/shadowsocks-libev/config.json
的配置文件,我们可以根据需要参考以下配置文件进行修改:
{
"server": "0.0.0.0",
"server_port": 10443,
"password": "zzz.buzz",
"method": "aes-256-cfb",
"mode": "tcp_and_udp"
}
"server"
: 选填,默认 "0.0.0.0"
。配置客户端时填入服务器的实际 IP。"0.0.0.0"
表明服务端接受来自任何网络接口的连接。配置服务端时填入 "0.0.0.0"
总是能生效,而不必填入服务器自身的 IP。"server_port"
: 必填。需要在客户端配置时填入相同的值。此处填入服务端要监听的端口。需要选择 1024 或以上的端口号,否则启动 ss-server
时将会需要 root 权限,而默认的服务文件则是以 nobody 用户启动 Shadowsocks 的。如需选用低于 1024 的端口,也可执行命令 sudo setcap 'cap_net_bind_service=+ep' /usr/bin/ss-server
赋予相应权限,后续就可以使用 nobody 用户或普通用户启动 Shadowsocks。"password"
: 必填。需要在客户端配置时填入相同的值。连接服务端所需的密码,建议替换为复杂密码,避免被攻击者暴力破解。"method"
: 选填,默认 "rc4-md5"
。需要在客户端配置时填入相同的值。服务端所用的加密方法,推荐以下几种算法:
"chacha20-ietf-poly1305"
具有优秀的安全性,更佳的性能,属于 AEAD 加密算法,少部分客户端(如 iOS Wingy)不支持此算法;"aes-256-cfb"
具有足够安全性,且被各服务端及客户端广泛支持;"rc4-md5"
算法快速,且具有一定的安全性,适合运算能力受限的设备如路由器等。"mode"
: 选填,默认 "tcp_only"
。服务器所要监听的协议,可填 "tcp_only"
, "udp_only"
和 "tcp_and_udp"
。"tcp_and_udp"
相当于命令行上提供 -u
参数;填入 "udp_only"
相当于命令行上提供 -U
参数。对于配置服务端,完成以上几项配置就足够了。
如果想要变更默认的配置文件,或者提供其他命令行参数,我们可以修改 /etc/sysconfig/shadowsocks-libev
:
# Configuration file
CONFFILE="/etc/shadowsocks-libev/config.json"
# Extra command line arguments
DAEMON_ARGS="-u"
其中 CONFFILE
指定了 shadowsocks-libev 所读取的配置文件;DAEMON_ARGS
则指定了额外的命令行参数,此处的 "-u"
表示启用 UDP 协议。
需要注意的是,命令行参数 DAEMON_ARGS
比配置文件 CONFFILE
中指定的选项优先级要更高一些。
CentOS/RHEL 7 系统自带了防火墙,为了使我们的 Shadowsocks 服务器能够正常工作,我们还需要添加相应的防火墙规则。
假设我们在配置 Shadowsocks 服务器的端口时填入了 "server_port": 10443
,那我们可以使用以下命令:
firewall-cmd --permanent --add-port=10443/tcp
firewall-cmd --permanent --add-port=10443/udp
firewall-cmd --reload
如果使用的是其他端口,则按实际情况相应地替换命令中的端口即可。
另外,如果服务器是运行在 VPS 或云服务器上,则往往还需要在云服务商的控制面板中配置相应的防火墙规则。
有了 Shadowsocks 服务端的配置文件后,我们通过 systemd 启动 Shadowsocks 的服务端服务:
systemctl start shadowsocks-libev
要确认 Shadowsocks 的服务运行状态及最新日志,我们可以执行命令:
systemctl status shadowsocks-libev
要查看 Shadowsocks 服务的全部日志,我们可以执行命令:
journalctl -u shadowsocks-libev
上文中,我们通过 systemctl start
启动了服务,但是如果我们想要服务能在开机时自动启动,还需要执行以下命令:
systemctl enable shadowsocks-libev
至此,服务端所需要的所有配置就都已经完成了。
锐速是一款网络优化工具 具体不多介绍
service serverSpeeder start
启动锐速,加载加速模块;使用/serverspeeder/etc/config 文件中的配置作为模块加载时的初始化参数;
service serverSpeeder stop
停止锐速,卸载加速模块;停止锐速前请确认没有其它进程在访问/proc/net/appex/目录,例如确认控制台当前目录是否是/proc/net/appex/;
service serverSpeeder reload
在不停止锐 速运行的情况下实时修改锐速参数配置 , 修 改/serverspeeder/etc/config 文件的配置后运行此命令,此时加速模块不退出,参数被实时修改;
service serverSpeeder restart
重启锐速;
service serverSpeeder status
查看当前锐速的实时运行状态;授权状态到期时间,版本号,系统序列号,加速连接数,加速速率,配置信息等;
service serverSpeeder stats
实时显示每个加速引擎的连接数、流量,以及所有引擎的总的连接数和流量;其中连接数统计包括网络连接数(sessions),tcp 连接数(tcp sessions),已加速的 tcp 连接数(accelerated sessions)以及活动的 tcp 连接数(active tcp sessions);流量统计包括流入(in)流量统计和流出(out)流量统计,单位均为 kbit/s;一般情况下,所有引擎的总连接数及流量即为服务器的互联网连接数及流量;
service serverSpeeder renewLic
当有新的 License 文件可用时,联网更新 License 文件并重启锐速;
service serverSpeeder update
当有新的锐速版本可用时,联网更新锐速并重启锐速;
看了网上的通配符一般取不到有两个点或者更多点的二级域名邮箱。
我写了一个,不管是三级域名还是四级域名都可以匹配出来
([a-zA-Z0-9_-]+@[a-zA-Z0-9_-]+\.[\.a-zA-Z0-9_-]+)
Lorem ipsum dolor sit amet enim. Etiam ullamcorper. Suspendisse pellentesque dui.
Maecenas malesuada elit lectus felis, malesuada ultricies. Curabitur et ligula. Ut molestie ultricies porta urna. Vestibulum commodo volutpat a, convallis ac, laoreet enim. Phasellus fermentum in, dolor.